Коллектив был образован в 1974 году. С 1983 года по 2014 год оркестром бессменно руководил заслуженный работник культуры РФ, лауреат премии Правительства Российской Федерации «Душа России», почетный гражданин города Алейска Николай Николаевич Акатов. Благодаря его профессионализму, дирижерскому таланту и тонкому музыкальному восприятию у коллектива сформировался свой стиль исполнения. Обладая великолепными организаторскими способностями, Н.Н. Акатов объединял вокруг себя талантливых самодеятельных авторов и исполнителей в различных жанрах музыкального, поэтического, вокального искусства, в результате чего рождались уникальные тематические концертные программы, поражавшие слушателя и зрителя своей неординарностью и неповторимостью.
В 1991 году оркестр был удостоен звания «Народный самодеятельный коллектив Алтайского края».
В состав оркестра входят преподаватели детской школы искусств, ее выпускники, музыкальные работники общеобразовательных школ, детских садов. Коллектив неоднократно становился лауреатом краевого конкурса оркестров и ансамблей «Звени, струна!» имени Е. И. Борисова, трижды был удостоен высшей награды этого конкурса – Гран-при. Свидетельством роста исполнительского мастерства коллектива стали дипломы лауреата, полученные на Всероссийском конкурсе оркестров и ансамблей имени Н.Н. Калинина (г. Саратов, 2005, г. Новосибирск, 2008, г. Санкт-Петербург, 2009, г. Кемерово, 2012). В ноябре 2014 года оркестр был приглашен в Москву на финал VI Всероссийского конкурса оркестров и ансамблей русских народных инструментов имени Н.Н. Калинина.
В 2008 году оркестру присвоено почётное звание «Заслуженный коллектив самодеятельного художественного творчества Алтайского края».
В апреле 2014 года муниципальный оркестр города Алейска удостоен диплома «Лучший коллектив фестиваля» на краевом конкурсе-фестивале «Калина красная», посвященном 85-летию со дня рождения В.М. Шукшина.
Признанием многолетних профессиональных заслуг руководителя коллектива Николая Акатова стало присвоение муниципальному оркестру русских народных инструментов г. Алейска его имени.
С 2019 года коллективом руководит Алла Викторовна Захарова. В 2016 году об оркестре русских народных инструментов г. Алейска выпущена книга «Бесконечные грани искусства», автором–составителем которой является А.В. Захарова. В 2019 году оркестр был награжден Почетной грамотой Правительства Алтайского края.
Коллектив оркестра активно сотрудничает с победителем XIII Международного кинофестиваля «Время в кадре», обладателем диплома за «Лучший дебютный фильм» (2018) Владимиром Егоровым – автором фильма «Взмах Веры» (2018), созданного в память о дирижере муниципального оркестра русских народных инструментов г. Алейска Николае Акатове.
Оркестр любим в родном городе, крае и известен за его пределами. Коллектив много гастролирует, знакомя зрителей с многообразием отечественных и зарубежных музыкальных традиций.